基于16S rRNA基因扩增子测序技术研究云南野生小型哺乳动物肠道菌群多样性
基于16S rRNA基因扩增子测序技术研究云南野生小型哺乳动物肠道菌群多样性
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北京大学深圳研究生院环境与能源学院,深圳518055%南方医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,广东省单细胞技术与应用重点实验室,广州510515
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以生活在同一生境,但具有不同进化关系和不同食性的野生哺乳类动物(鼠科、猬科和鼩鼱科)为研究对象,通过16S rRNA基因扩增子测序,分析和比较其肠道菌群.共识别出5378个操作分类单位(OTUs),主要隶属 Firmicutes(40.55％),Proteobacteria(34.60％)和 Bacteroidetes(13.67％).Firmicutes 和 Bacteroidetes 是鼠科的优势菌门,Proteobacteria是猬科和鼩鼱科的优势菌门.多样性分析表明,鼠科、猬科与鼩鼱科的肠道微生物多样性及群落结构具有显著性差异;LEfSe分析表明,鼠科中存在更多与复杂碳水化合物发酵相关的细菌,猬科和鼩鼱科中含较多氨基酸发酵菌;益生菌(如Lactobacillus和Lactococcu...
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基于16S rRNA基因扩增子测序技术研究云南野生小型哺乳动物肠道菌群多样性
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Primary Identifiers
Record Identifier
TN_cdi_wanfang_journals_bjdxxb202202015
Permalink
https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_bjdxxb202202015
Other Identifiers
ISSN
0479-8023
DOI
10.13209/j.0479-8023.2022.002
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