毛竹小RNA高通量测序及病毒分析
毛竹小RNA高通量测序及病毒分析
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毛竹小RNA高通量测序及病毒分析
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Publisher
中国林业科学研究院热带林业研究所,广东广州 510520%中国林业科学研究院林业研究所,林木遗传育种国家重点实验室,北京100091
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林业科学研究, 2014, Vol.27 (3), p.335-340
Language
Chinese
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中国林业科学研究院热带林业研究所,广东广州 510520%中国林业科学研究院林业研究所,林木遗传育种国家重点实验室,北京100091
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以毛竹叶片为材料,采用小RNA高通量测序结合生物信息学对小RNA数据库进行组装,进一步分析了毛竹中存在的病毒和类病毒,并采用RT-PCR和RACE进行验证.结果表明：在竹子样品中存在水稻东格鲁病毒（RT-BV）,覆盖率达到91.0％.在毛竹样品中扩增得到1 992 bp RTBV病毒类似序列,占其基因组的24.9％.RTBV病毒在多个毛竹样品中存在且不存在多态性.RTBV病毒可能是一个古老的植物病毒,在进化过程中禾本科植物将其序列整合到基因组中来防御RTBV病毒的浸染.
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毛竹小RNA高通量测序及病毒分析
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Record Identifier
TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201403007
Permalink
https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201403007
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ISSN
1001-1498
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