基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘
基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘
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基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘
Author / Creator
Publisher
中国林业科学研究院林业研究所 北京 100091
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林业科学研究, 2014, Vol.27 (6), p.758-763
Language
Chinese
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Publisher
中国林业科学研究院林业研究所 北京 100091
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Contents
应用新一代高通量测序技术（Illumina Solexa）,对中麻黄（Ephedra intermedin）同萌期的种子进行转录组测序,数据重头（denovo）组装后,共获得52 007条Unigene序列,总长为25043 596 bp.COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了64 751个GO功能注释,17 701个COG功能注释以及16 942个KEGG注释,并从KEGG通路中找到参与黄酮类化合物合成途径的关键基因片段283个,其中包含了查尔酮合酶基因、细胞色素相关基因和花青素还原酶等基因.中麻黄转录组测序工作的完成,极大地扩充了麻黄的基因资源,为麻黄属植物分子系统进化分析、抗性和药用功能基因的发掘与利用、遗传改良等研究奠定基础.
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基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘
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Record Identifier
TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201406008
Permalink
https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201406008
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ISSN
1001-1498
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