利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征
利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征
Publication information
Publisher
西南大学生命科学学院,重庆400715%中国科学院高原生物适应与进化重点实验室,中国科学院西北高原生物研究所,青海西宁810008
More information
Scope and Contents
Contents
S718.46; 利用Illumina HiSeqTM 2000平台对采自青海玉树的青杨进行高通量测序,SSR分析共获得7 067条SSR序列,复合型SSR共525条,发生频率0.149,平均跨度4 531.87 bp.SSR重复类型中,单核苷酸重复类型最多(33.96％);三核苷酸重复类型次之(31.00％);二核苷酸重复类型位居第三(27.69％);四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复类型SSR含量很少(＜8％).二核苷酸重复类型中,AG重复类型所占比例最高,GA次之,CT、TC则紧随其后;三核苷酸重复类型中,AAG重复类型所占比例最高,GAA次之,TTC、AGA、GAG、CAG、TCT、TGG等重复类型数量相近.SNP分析发现,L1A中含SNP 162 343个,L2A中含SNP 229...
Alternative Titles
Full title
利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征
Identifiers
Primary Identifiers
Record Identifier
TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201501006
Permalink
https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201501006
Other Identifiers
ISSN
1001-1498
How to access this item
Log in as a Library member
