Log in to save to my catalogue

滇东南濒危植物长梗杜鹃转录组微卫星特征分析

滇东南濒危植物长梗杜鹃转录组微卫星特征分析

https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201704001

滇东南濒危植物长梗杜鹃转录组微卫星特征分析

About this item

Full title

滇东南濒危植物长梗杜鹃转录组微卫星特征分析

Publisher

中国林业科学研究院资源昆虫研究所,云南昆明,650233

Journal title

林业科学研究, 2017, Vol.30 (4), p.533-541

Language

Chinese

Formats

Publication information

Publisher

中国林业科学研究院资源昆虫研究所,云南昆明,650233

More information

Scope and Contents

Contents

[目的] 全面了解滇东南特有濒危植物长梗杜鹃转录组SSR位点的分布及序列特征,为长梗杜鹃的保护和合理开发利用提供遗传学资料,为同属植物及近缘种SSR标记的开发及遗传研究提供便利。[方法] 利用Illumina Hiseq 4000高通量测序平台对长梗杜鹃叶片进行转录组测序,再通过MISA软件对测序所得Unigenes进行SSR位点的发掘和分析。[结果] 发现含SSR的序列17 354条,共得到23 192个SSR,出现频率为31.30%,平均每3 kb出现1个SSR。二碱基和三碱基重复为长梗杜鹃SSR主要重复单元类型,分别占SSR总数的69.25%和15.07%,187种重复基元中,所占比例最高的是(AG/CT)n(62.01%),其次是(A/T)n(12.34%)、(AC/GT)n(4.5...

Alternative Titles

Full title

滇东南濒危植物长梗杜鹃转录组微卫星特征分析

Authors, Artists and Contributors

Identifiers

Primary Identifiers

Record Identifier

TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201704001

Permalink

https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201704001

Other Identifiers

ISSN

1001-1498

DOI

10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.04.001

How to access this item