铁皮石斛phytocyanin基因家族全基因组分析
铁皮石斛phytocyanin基因家族全基因组分析
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林木遗传育种国家重点实验室,国家林业局林木培育重点实验室,中国林业科学研究院林业研究所,北京100091
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S718.46; [目的]探讨Phytocyanins (PCs)在铁皮石斛发育过程和逆境胁迫环境下的潜在功能.[方法]利用拟南芥和水稻phytocyanin基因家族蛋白序列(AtPCs和OsPCs),采用本地化软件BLASTP对铁皮石斛全基因组数据库进行搜索,并采用SMART和pfam数据库验证质体蓝素样结构域,获得铁皮石斛phytocyanin基因家族编码序列(DoPCs);利用Signal P4.1、Big-PI Plant Predictor、NetNGlyc1.0 Server等在线软件对DoPC家族序列的结构特点进行分析;利用软件ClustalW和MEGA对DoPC基因进行氨基酸序列的比对和系统进化分析;利用转录组数据绘制heatmap图对DoPCs基因在与美孢胶膜菌共生萌发的种...
Alternative Titles
Full title
铁皮石斛phytocyanin基因家族全基因组分析
Identifiers
Primary Identifiers
Record Identifier
TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201802014
Permalink
https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_lykxyj201802014
Other Identifiers
ISSN
1001-1498
DOI
10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.02.014
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