汉滩病毒糖蛋白Gn的T细胞表位预测及其跨种属验证
汉滩病毒糖蛋白Gn的T细胞表位预测及其跨种属验证
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空军军医大学基础医学院生物武器损伤防治药物重点实验室,陕西西安 710032
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Contents
R512.8%R373.3+; 目的 筛选、鉴定并验证汉滩病毒(HTNV)包膜糖蛋白-N末端(Gn)上的免疫反应性表位.方法 通过UniProt数据库获取HTNV 76-118株Gn蛋白序列.采用IEDB、SMMPMBEC、NetMHCpan 4.1、SYFPEITHI、Rankpep算法预测表位亲和力,VaxiJen v2.0分析免疫原性,Blastp工具计算保守性,HPEPDOCK和EpiDOCK模拟pMHC对接,TBtools进行双向聚类分析,酶联免疫斑点(ELISpot)实验评价表位细胞免疫反应性.结果 通过UniProt数据库获得了HTNV 76-118株Gn蛋白序列(PRO_0000036816).整合5种亲和力算法,在小鼠H-2亚型中获得了61个优势表位,在人主要组织相容性复合...
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Full title
汉滩病毒糖蛋白Gn的T细胞表位预测及其跨种属验证
Identifiers
Primary Identifiers
Record Identifier
TN_cdi_wanfang_journals_jfjyxzz202309002
Permalink
https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_jfjyxzz202309002
Other Identifiers
ISSN
0577-7402
DOI
10.11855/j.issn.0577-7402.1489.2023.0419