利用高通量转录组测序对肺鳞癌基因型的研究
利用高通量转录组测序对肺鳞癌基因型的研究
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北京肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室胸外科二病区, 北京,100142%北京市理化分析测试中心, 北京,100089
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Chinese
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北京肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室胸外科二病区, 北京,100142%北京市理化分析测试中心, 北京,100089
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背景与目的目前尚无有效的靶向药物用于肺鳞癌的临床治疗,在肺腺癌中有效的靶向药物却无法让鳞癌患者获益,而研究者对肺鳞癌的靶点知之甚少。本研究重点筛选并鉴定肺鳞癌的特异关键基因,为肺鳞癌的治疗提供新的靶点。方法转录组测序检测5例肺鳞癌患者的配对肺癌组织及正常肺组织样本,使用生物信息学分析筛选两组之间的差异编码基因,进而应用实时定量PCR验证关键差异基因在肺癌细胞系的表达情况。结果转录组测序结果显示,与正常肺组织相比,肺鳞癌组织上调的差异基因数目为534条。位于前十位肺癌组织高表达的基因包括GAGE12J、SPRR3、PRAME、SPRR1A、SPRR2E、MAGEA3、SPRR1B、IL36G、TMPRSS11D和SPRR2D。进而于不同生物特征的肺癌细胞系H520、GLC82、A549、H12...
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利用高通量转录组测序对肺鳞癌基因型的研究
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Record Identifier
TN_cdi_wanfang_journals_zgfazz201711001
Permalink
https://devfeature-collection.sl.nsw.gov.au/record/TN_cdi_wanfang_journals_zgfazz201711001
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ISSN
1009-3419
E-ISSN
1999-6187
DOI
10.3779/j.issn.1009-3419.2017.11.01